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黒崎久志が大宮アルディージャに移籍し、前年の路線を変更し堅実なサッカーを展開。FW船越優蔵、FWマルクス、MF安英学らの活躍もあり順調に勝ち点を積み重ねたが、船越がアキレス腱断裂により長期離脱となると失速し、最終順位は3位となり昇格はならなかった。
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| 節 | 試合日 | 時刻 | ホーム | スコア | アウェイ | スタジアム | 入場者数 |
| 01 | 03/03(日) | 14:00 | 水戸ホーリーホック | 0-1 | アルビレックス新潟 | ひたちな | 3,018 |
| 02 | 03/09(土) | 15:04 | 横浜FC | 0-2 | アルビレックス新潟 | 三ツ沢 | 2,840 |
| 03 | 03/17(日) | 13:35 | アルビレックス新潟 | 0-1 | 大分トリニータ | 新潟ス | 35,245 |
| 04 | 03/21(木) | 14:00 | アルビレックス新潟 | 2-2 | 湘南ベルマーレ | 新潟陸 | 9,125 |
| 05 | 03/24(日) | 13:01 | サガン鳥栖 | 1-1 | アルビレックス新潟 | 鳥栖 | 2,507 |
| 06 | 03/30(土) | 14:00 | モンテディオ山形 | 1-1 | アルビレックス新潟 | 山形県 | 3,721 |
| 07 | 04/06(土) | 15:03 | アルビレックス新潟 | 0-1 | アビスパ福岡 | 新潟ス | 22,021 |
| 08 | 04/10(水) | 19:01 | 大宮アルディージャ | 4-1 | アルビレックス新潟 | 大宮 | 2,785 |
| 09 | 04/14(日) | 14:04 | アルビレックス新潟 | 2-1 | 川崎フロンターレ | 新潟陸 | 12,309 |
| 10 | 04/20(土) | 14:05 | ヴァンフォーレ甲府 | 1-3 | アルビレックス新潟 | 小瀬 | 3,667 |
| 11 | 04/24(水) | 19:04 | アルビレックス新潟 | 5-2 | セレッソ大阪 | 新潟陸 | 11,699 |
| 12 | 04/27(土) | 14:00 | アルビレックス新潟 | 2-0 | 横浜FC | 新潟ス | 32,102 |
| 13 | 05/03(金) | 15:00 | 湘南ベルマーレ | 1-4 | アルビレックス新潟 | 平塚 | 4,845 |
| 14 | 05/06(月) | 14:01 | アルビレックス新潟 | 6-2 | サガン鳥栖 | 新潟陸 | 12,088 |
| 15 | 05/12(日) | 14:03 | アルビレックス新潟 | 1-0 | モンテディオ山形 | 新潟陸 | 13,213 |
| 16 | 07/06(土) | 19:04 | アビスパ福岡 | 0-1 | アルビレックス新潟 | 博多球 | 10,044 |
| 17 | 07/10(水) | 19:01 | アルビレックス新潟 | 2-2 | 大宮アルディージャ | 新潟ス | 17,764 |
| 18 | 07/13(土) | 19:04 | セレッソ大阪 | 1-3 | アルビレックス新潟 | 長居 | 10,301 |
| 19 | 07/20(土) | 18:00 | アルビレックス新潟 | 1-0 | 水戸ホーリーホック | 新潟ス | 35,809 |
| 20 | 07/24(水) | 19:00 | 川崎フロンターレ | 2-0 | アルビレックス新潟 | 等々力 | 3,363 |
| 21 | 07/27(土) | 18:00 | アルビレックス新潟 | 1-0 | ヴァンフォーレ甲府 | 新潟ス | 33,906 |
| 22 | 08/03(土) | 19:00 | 大分トリニータ | 1-1 | アルビレックス新潟 | 大分ス | 18,743 |
| 23 | 08/07(水) | 19:03 | アルビレックス新潟 | 2-0 | モンテディオ山形 | 新潟ス | 21,828 |
| 24 | 08/10(土) | 18:04 | アルビレックス新潟 | 0-0 | セレッソ大阪 | 新潟ス | 42,211 |
| 25 | 08/16(金) | 19:01 | 大宮アルディージャ | 0-1 | アルビレックス新潟 | 埼玉 | 19,782 |
| 26 | 08/21(水) | 19:00 | アルビレックス新潟 | 2-1 | 川崎フロンターレ | 新潟陸 | 10,028 |
| 27 | 08/25(日) | 18:00 | 横浜FC | 1-2 | アルビレックス新潟 | 三ツ沢陸 | 4,177 |
| 28 | 08/31(土) | 18:04 | 水戸ホーリーホック | 2-1 | アルビレックス新潟 | 笠松 | 4,954 |
| 29 | 09/07(土) | 18:00 | アルビレックス新潟 | 2-2 | アビスパ福岡 | 新潟ス | 31,695 |
| 30 | 09/11(水) | 19:01 | ヴァンフォーレ甲府 | 2-1 | アルビレックス新潟 | 小瀬 | 3,740 |
| 31 | 09/14(土) | 18:00 | アルビレックス新潟 | 2-1 | 湘南ベルマーレ | 新潟ス | 34,627 |
| 32 | 09/21(土) | 19:04 | サガン鳥栖 | 0-2 | アルビレックス新潟 | 鳥栖 | 3,464 |
| 33 | 09/25(水) | 19:04 | アルビレックス新潟 | 1-1 | 大分トリニータ | 新潟ス | 39,068 |
| 34 | 09/28(土) | 14:04 | モンテディオ山形 | 0-1 | アルビレックス新潟 | 山形県 | 4,742 |
| 35 | 10/05(土) | 14:04 | 川崎フロンターレ | 1-2 | アルビレックス新潟 | 等々力 | 7,063 |
| 36 | 10/09(水) | 19:04 | アルビレックス新潟 | 1-1 | ヴァンフォーレ甲府 | 新潟陸 | 9,507 |
| 37 | 10/12(土) | 15:00 | 湘南ベルマーレ | 1-1 | アルビレックス新潟 | 平塚 | 7,087 |
| 38 | 10/19(土) | 14:03 | アルビレックス新潟 | 5-0 | 横浜FC | 新潟陸 | 12,462 |
| 39 | 10/23(水) | 19:04 | 大分トリニータ | 2-1 | アルビレックス新潟 | 大分陸 | 13,217 |
| 40 | 10/29(火) | 19:03 | アルビレックス新潟 | 1-1 | サガン鳥栖 | 新潟陸 | 9,849 |
| 41 | 11/02(土) | 14:04 | アビスパ福岡 | 2-2 | アルビレックス新潟 | 博多球 | 4,720 |
| 42 | 11/09(土) | 14:05 | アルビレックス新潟 | 2-2 | 大宮アルディージャ | 新潟陸 | 11,538 |
| 43 | 11/16(土) | 15:04 | セレッソ大阪 | 3-0 | アルビレックス新潟 | 長居 | 32,067 |
| 44 | 11/24(日) | 13:04 | アルビレックス新潟 | 3-1 | 水戸ホーリーホック | 新潟陸 | 14,413 |
1997-1998と同じくパンツは青のままだが、シャツに5本の太い青ストライプが加わった。うち2001-02はシャツの肩とパンツのサイドが、カッパマークが多数並ぶラインとなった。
| 掲出箇所 | スポンサー名 | 表記 |
| 胸 | 亀田製菓 | 亀田製菓 |
| 背中 | B's INTERNATIONAL | B's INT'L |
| 袖 | 新潟県 | 2002W杯新潟県推進委員会 |
| パンツ | 新潟日報社 | 新潟日報 |