Nkx2.5

NKX2-5
PDBに登録されている構造 PDB オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj PDBのIDコード一覧 3RKQ, 4S0H
識別子
記号	NKX2-5, CHNG5, CSX, CSX1, HLHS2, NKX2.5, NKX2E, NKX4-1, VSD3, NK2 homeobox 5
外部ID	OMIM: 600584 MGI: 97350 HomoloGene: 3230 GeneCards: NKX2-5
遺伝子の位置 (ヒト) 染色体 5番染色体 (ヒト)[1] バンド データ無し 開始点 173,232,109 bp[1] 終点 173,235,311 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス) 染色体 17番染色体 (マウス)[2] バンド データ無し 開始点 27,057,638 bp[2] 終点 27,063,983 bp[2]
RNA発現パターン さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 • DNA-binding transcription factor activity • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • 転写因子結合 • protein homodimerization activity • serum response element binding • クロマチン結合 • 血漿タンパク結合 • DNA結合 • sequence-specific DNA binding • transcription coregulator activity • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 細胞の構成要素 • 細胞質 • 細胞核 • transcription regulator complex • RNA polymerase II transcription regulator complex • 高分子複合体 • protein-DNA complex 生物学的プロセス • cardiac conduction system development • apoptotic process involved in heart morphogenesis • bundle of His development • regulation of transcription by RNA polymerase II • atrioventricular node cell development • outflow tract morphogenesis • embryonic heart tube development • 脈管形成 • heart looping • atrial septum morphogenesis • positive regulation of heart contraction • proepicardium development • pulmonary myocardium development • 心収縮 • ventricular cardiac muscle cell development • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • pharyngeal system development • atrioventricular node development • cardiac ventricle formation • regulation of transcription, DNA-templated • 心筋収縮 • regulation of cardiac muscle cell proliferation • heart trabecula formation • ventricular septum morphogenesis • cardiac muscle cell differentiation • Purkinje myocyte differentiation • 脾臓発生 • positive regulation of transcription, DNA-templated • 心臓発生 • positive regulation of neuron differentiation • positive regulation of cardioblast differentiation • septum secundum development • atrial cardiac muscle cell development • 細胞分化 • adult heart development • right ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • cardiac muscle cell proliferation • BMP signaling pathway • ventricular trabecula myocardium morphogenesis • outflow tract septum morphogenesis • negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • 甲状腺発生 • canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of transcription, DNA-templated • sarcomere organization • cardiac ventricle morphogenesis • regulation of cardiac conduction • cardiac muscle tissue development • embryonic heart tube left/right pattern formation • heart morphogenesis • cardiac muscle tissue morphogenesis • 多細胞個体の発生 • positive regulation of gene expression • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of sodium ion transport • negative regulation of myotube differentiation • regulation of cardiac muscle contraction • ventricular cardiac myofibril assembly • atrioventricular node cell fate commitment • positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • 造血 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種	ヒト	マウス
Entrez	1482	18091
Ensembl	ENSG00000183072	ENSMUSG00000015579
UniProt	P52952,E5RH49	P42582
RefSeq (mRNA)	NM_004387 NM_001166175 NM_001166176	NM_008700
RefSeq (タンパク質)	NP_001159647 NP_001159648 NP_004378	NP_032726
場所 (UCSC)	Chr 5: 173.23 – 173.24 Mb	Chr 5: 27.06 – 27.06 Mb
PubMed検索	[3]	[4]
ウィキデータ
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Nkx2.5またはNkx2-5（NK-2 transcription factor related, locus 5）はホメオボックス配列を持ち、NK-2ファミリーに属する転写因子の1つで、心臓の発生に大きく関わっている。Csx（cardiac-specific homeobox）とも呼ばれる。発生初期の心筋前駆細胞に発現するとともに、出生後から成体に至るまで心筋細胞に発現が認められる。NK-2ファミリーの転写因子はショウジョウバエの背側管（dorsal vessel）の発生に関わるtinmanと相同性がある。

配列と構造

Nkx2.5は主としてTN(tinman)ドメイン、ホメオドメイン（ホメオボックス）、NK2(NK-2-SD)ドメインの3つのドメインから構成される。TNドメインは10アミノ酸残基の長さで、他のタンパク質との相互作用に利用されるとされる。ホメオドメインは60アミノ酸残基の長さがありヘリックス・ターン・ヘリックス構造を有するDNAへの結合部位である。NK2ドメインはtinmanにはないドメインで、これも他のタンパク質との相互作用に役立つと考えられている。

誘導

Nkx2.5は心原基（cardiac crescent）の形成期にBMP（下流の転写因子はSmad）やGATA、FGFなどによって誘導されることが知られる。実際の心臓の発生では側板中胚葉の細胞が隣接する内胚葉からBMP2、FGFなどの傍分泌を受けて、Nkx2.5やGata4を発現する心筋前駆細胞へと分化する。一方で、Nkx2.5はSmadに働きかけてフィードバック的にBMPシグナルを抑制することで心筋細胞の数を制限している^[5]。Nkx2.5はGata4と同様、心房や心室に均一に発現する。Nkx2.5は他の転写因子とヘテロ二量体を形成することが出来る。例えば心房性ナトリウム利尿ペプチドをコードするANF遺伝子はNkx2.5とGata4の二量体によって活性化され^[6]、Nkx2.5とTbx2の二量体によって抑制される^[7]。

参考文献

• 山岸 敬幸、白石 公、先天性心疾患を理解するための臨床心臓発生学 ISBN 978-4-7583-0148-0
• Heather Bartlett, Gert Jan C. Veenstra, Daniel L. Weeks, Examining Cardiac NK-2 Genes in Early Heart Development.Pediatr Cardiol. 2010 Apr;31(3):335-41. Epub 2009 Dec 5.PMID 19967350

出典

1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000183072 - Ensembl, May 2017
2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015579 - Ensembl, May 2017
3. ↑ Human PubMed Reference:
4. ↑ Mouse PubMed Reference:
5. ↑ Prall OW, Watanabe Y et al. An Nkx2-5/Bmp2/Smad1 negative feedback loop controls heart progenitor specification and proliferation. Cell.2007;128:947-959,PMID 17350578
6. ↑ D. Durocher et al, The atrial natriuretic factor promoter is a downstream target for Nkx-2.5 in the myocardium. Mol Cell Biol. 1996 Sep;16(9):4648-55.PMID 8756621
7. ↑ Petra Habets et al,Cooperative action of Tbx2 and Nkx2.5 inhibits ANF expression in the atrioventricular canal: implications for cardiac chamber formation.Genes Dev. 2002 May 15; 16(10): 1234–1246. PMID 12023302

外部リンク

• NKX2-5 protein, human - MeSH・アメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス（英語）