クロストリジウム科

クロストリジウム科
Clostridium difficile（クロストリジウム・ディフィシル）の電子顕微鏡画像
分類
ドメイン : 真正細菌 Bacteria 界 : バシラス界 Bacillati 門 : バシラス門 Bacillota 綱 : クロストリジウム綱 Clostridia 目 : ユーバクテリウム目 Eubacteriales 科 : クロストリジウム科 Clostridiaceae
学名
Clostridiaceae Pribram 1933[1] (IJSEMリストに掲載 1980)[2] 修正 Spring 2020[3]
タイプ属
クロストリジウム属 Clostridium Prazmowski 1880[4] (IJSEMリストに掲載 1980)[2] 修正 Lawson & Rainey 2016[5] (IJSEMリストに掲載 2016)[6]
シノニム
シノニム（全6科） カロラマター科 Caloramatoraceae Chuvochina et al. 2024[7] (IJSEMリストに掲載 2024)[8] ルチスポラ科 Lutisporaceae Chuvochina et al. 2024[7] (IJSEMリストに掲載 2024)[8] オキソバクター科 Oxobacteraceae Chuvochina et al. 2024[7] (IJSEMリストに掲載 2024)[8] プロテイニボラス科 Proteiniboraceae Chuvochina et al. 2024[7] (IJSEMリストに掲載 2024)[8] サーモブラチウム科 Thermotaleaceae Chuvochina et al. 2024[7] (IJSEMリストに掲載 2024)[8] チンダリア科 Tindalliaceae Chuvochina et al. 2024[7] (IJSEMリストに掲載 2024)[8]
下位分類(属) 2026年9月現在[9]
正式に認められた属（全33属） Abyssisolibacter Kim et al. 2024[10] (IJSEMリストに掲載 2024)[11] アナエロミクロビウム属 Anaeromicrobium Zhang et al. 2017[12] (IJSEMリストに記載 2017)[13] アナエロモナス属 Anaeromonas Zhang et al. 2022[14] (IJSEMリストに記載 2022)[15] アナエロフィルス属 Anaerophilus Zhang et al. 2025[16] (IJSEMリストに掲載 2025)[17] アナエロソリバクター属 Anaerosolibacter Hong et al. 2015 アナエロスポロバクター属 Anaerosporobacter Jeong et al. 2007[18] (IJSEMリストに掲載 2007)[19] アノキシナトロヌム属 Anoxynatronum Garnova et al. 2003[20] (IJSEMリストに記載 2003)[21] カロラマター属 Caloramator Collins et al. 1994[22] (IJSEMリストに記載 1995)[23] 修正 Ogg & Patel 2011[24] (IJSEMリストに記載 2011)[25] クロストリジウム属 Clostridium Prazmowski 1880[4] (IJSEMリストに掲載 1980)[2] 修正 Lawson & Rainey 2016[5] (IJSEMリストに掲載 2016)[6] Crassaminicella Lakhal et al. 2015[26] (IJSEMリストに掲載 2015)[27] 修正 Li et al. 2021[28] (IJSEMリストに記載 2022)[29] Fervidicella Ogg & Patel 2010[30] (IJSEMリストに掲載 2010)[31] Fonticella Fraj et al. 2013[32] (IJSEMリストに記載 2013)[33] ゲオスポロバクター属 Geosporobacter Klouche et al. 2007[34] (IJSEMリストに掲載 2007)[19] Haloimpatiens Wu et al. 2016[35] (IJSEMリストに掲載 2016)[6] Hathewaya Lawson & Rainey 2016[5] (IJSEMリストに掲載 2016)[6] Hungatella Kaur et al. 2014[36] (IJSEMリストに掲載 2014)[37] 修正 Heng & Kittelmann 2024[38] (IJSEMリストに掲載 2024)[39] ハイドロゲニスポラ属 Hydrogenispora Liu et al. 2014[40] (IJSEMリストに掲載 2014)[41] Inconstantimicrobium Wylensek et al. 2021[42] (IJSEMリストに掲載 2021)[43] Isachenkonia Zavarzina et al. 2020[44] (IJSEMリストに掲載 2020)[45] ラクトニファクター属 Lactonifactor Clavel et al. 2007[46] (IJSEMリストに掲載 2007)[47] ルチスポラ属 Lutispora Shiratori et al. 2008[48] (IJSEMリストに掲載 2008)[49] 修正 El Houari et al. 2023[50] (IJSEMリストに記載 2023)[51] マリニスロポバクター属 Marinisporobacter Vandieken et al. 2017[52] (IJSEMリストに掲載 2017)[53] Oceanirhabdus Pi et al. 2013[54] (IJSEMリストに掲載 2014)[55] オキソバクター属 Oxobacter Collins et al. 1994[22] (IJSEMリストに記載 1995)[23] Pilosibacter Yan et al. 2024[56] (IJSEMリストに記載 2024)[57] プロテイニボラス属 Proteiniborus Niu et al. 2008[58] (IJSEMリストに掲載 2008)[59] Proteiniclasticum Zhang et al. 2010[60] (IJSEMリストに掲載 2010)[61] 修正 Namirimu et al. 2022[62] (IJSEMリストに掲載 2022)[63] サリメソフィロバクター属 Salimesophilobacter Zhang et al. 2010[64] (IJSEMリストに掲載 2010)[61] サルチナ属 Sarcina Goodsir 1842[65] (IJSEMリストに掲載 1980)[2] サーモブラチウム属 Thermobrachium Engle et al. 1996[66] (IJSEMリストに記載 1997)[67] Thermotalea Ogg & Patel 2009[68] (IJSEMリストに掲載 2009)[69] チンダリア属 Tindallia Kevbrin et al. 1999[70] (IJSEMリストに記載 1999)[71] Youngiibacter Lawson et al. 2014[72] (IJSEMリストに掲載 2014)[73] シノニム アナエロバクター属 Anaerobacter Duda et al. 1996[74] (IJSEMリストに記載 1996)[75] Clostridium属のシノニム

クロストリジウム科（クロストリジウムか、Clostridiaceae）は、ユーバクテリウム目（Eubacteriales）の科である。

歴史

クロストリジウム科に追加された属の以前の分類は、多くの場合、これらの属のタイプ種が系統学的にクロストリジウム属に誤分類されていたためであることに基づいている。 この誤分類は、伝統的なクロストリジウム属の分類学的構造のよく知られた問題の結果である。Collins（1994）の系統発生分析^[22]は、クロストリジウム属及び関連する分類群の種の16S rRNA系統解析の最初の大規模比較であった。 クロストリジウム属の種が単一系統を形成しなかったという事実は、 クロストリジウム種の小グループを1981年以来と比較した多くの研究で示されている。Collins（1994）とその後の研究でこの属に現在割り当てられている種の半分以上が、実際にタイプ種であるクロストリジウム・ブチリカムと密接に関連しておらず、系統学的な観点からは、新たに定義されたクロストリジウム属に含まれてはならないと結論することができる。 クロストリジウム属の広範な遺伝的多様性は、JohnsonとFrancisによって1975年に23S rRNA：DNAハイブリダイゼーション研究を用いて示されたが、16S rRNA系統解析アプローチは、この属と他の属との間の実際の系統学的関係を明らかにした。 クロストリジウム属は現在、命名法で152種の有効に記載された種を含む^[76]。 しかしながら、16S rRNA系統解析に基づいて、これらのうちの73種のみがクロストリジウム属のタイプ種の系統に含まれる 。

脚注