サイクリンK

CCNK
PDBに登録されている構造 PDB オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj PDBのIDコード一覧 2I53, 4CXA, 4NST, 4UN0, 5EFQ, 5ACB
識別子
記号	CCNK, CPR4, Cyclin K, IDDHDF
外部ID	OMIM: 603544 MGI: 1276106 HomoloGene: 14748 GeneCards: CCNK
遺伝子の位置 (ヒト) 染色体 14番染色体 (ヒト)[1] バンド データ無し 開始点 99,481,169 bp[1] 終点 99,535,044 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス) 染色体 12番染色体 (マウス)[2] バンド データ無し 開始点 108,145,838 bp[2] 終点 108,169,618 bp[2]
RNA発現パターン さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 • 血漿タンパク結合 • プロテインキナーゼ結合 • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity • protein serine/threonine kinase activity • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity 細胞の構成要素 • cyclin K-CDK12 complex • 細胞核 • cyclin K-CDK13 complex • 核質 • cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex • P-TEFb 生物学的プロセス • positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • positive regulation of phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain serine 2 residues • regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • transcription by RNA polymerase II • negative regulation by host of viral genome replication • positive regulation of transcription by RNA polymerase II • 細胞分裂 • 細胞周期 • タンパク質リン酸化 • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • positive regulation of phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種	ヒト	マウス
Entrez	8812	12454
Ensembl	ENSG00000090061	ENSMUSG00000021258
UniProt	O75909,G3V235	O88874,Q3U3M5
RefSeq (mRNA)	NM_001099402 NM_003858	NM_009832
RefSeq (タンパク質)	NP_001092872	NP_033962
場所 (UCSC)	Chr 14: 99.48 – 99.54 Mb	Chr 14: 108.15 – 108.17 Mb
PubMed検索	[3]	[4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト 閲覧/編集 マウス

サイクリンK（英: cyclin K）は、ヒトではCCNK遺伝子にコードされるタンパク質である^[5][6][7]。

機能

CCNK遺伝子にコードされるサイクリンKタンパク質は、サイクリンファミリーに属する。このサイクリンはコンフォメーション変化によってサイクリン依存性キナーゼ（CDK）への結合と活性化を行い、転写を調節する^[8][9]。サイクリンはCDKに結合して活性化し、標的タンパク質をリン酸化によって活性化するキナーゼ複合体が形成される。その後、標的とされたタンパク質は細胞周期の進行に関する決定を調節する。サイクリンKは、CDKとRNAポリメラーゼIIの双方の活性を調節する二重の役割を果たしている^[7]。サイクリンKはRNAへの結合を介した機構で転写活性化を行う^[10]。

相互作用

サイクリンKはCDK9、CDK12（英語版）、CDK13（英語版）を含む複数のCDKと相互作用することが示されており^[6][9]、RNAポリメラーゼIIのC末端ドメインのリン酸化の補助などの役割が知られている^[11]。サイクリンKは転写伸長のプロセシビティの誘導との関係が最もよく知られている^[8]。また、G₁期とS期におけるサイクリン活性も同定されているが、こうした機能の十分な理解は得られていない^[5][12]。

サイクリンKはHIVのNef（英語版）タンパク質とも相互作用する^[13]。Nefタンパク質の過剰発現下ではサイクリンKとCDK9の結合が誘導され、他のCDK9結合複合体による正の伸長因子活性が阻害される。その結果、特定のHIV-1遺伝子の発現が阻害される^[9][13]。CDK13はHIV mRNAのスプライシング機構と相互作用し、GagやEnv関連タンパク質の発現を低下させる^[10][12]。

サイクリンKは白血病細胞の成長に必要不可欠である。SETD1A（英語版）はFLOSドメインを介してサイクリンKに結合することが知られており^[14]、この相互作用はDNA損傷応答遺伝子の発現と白血病細胞の増殖に重要であることが示されている^[10][14]。

出典

関連文献

外部リンク

• Overview of all the structural information available in the PDB for UniProt: O75909 (Cyclin-K) at the PDBe-KB.