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セリンラセマーゼ

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SRR
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PDBのIDコード一覧

3L6B, 3L6R

識別子
記号SRR, ILV1, ISO1, serine racemase
外部IDOMIM: 606477 MGI: 1351636 HomoloGene: 22775 GeneCards: SRR
遺伝子の位置 (ヒト)
17番染色体 (ヒト)
染色体17番染色体 (ヒト)[1]
17番染色体 (ヒト)
SRR遺伝子の位置
SRR遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点2,303,383 bp[1]
終点2,325,260 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
11番染色体 (マウス)
染色体11番染色体 (マウス)[2]
11番染色体 (マウス)
SRR遺伝子の位置
SRR遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点74,797,185 bp[2]
終点74,816,774 bp[2]
遺伝子オントロジー
分子機能• threonine racemase activity
• ヌクレオチド結合
• calcium ion binding
• PDZ domain binding
• protein homodimerization activity
• L-serine ammonia-lyase activity
• isomerase activity
• glycine binding
• 金属イオン結合
• 触媒活性
• リアーゼ活性
• pyridoxal phosphate binding
• ATP binding
• magnesium ion binding
• D-serine ammonia-lyase activity
• serine racemase activity
細胞の構成要素• 細胞質
• 細胞膜
• apical part of cell
• neuronal cell body
• 細胞質基質
生物学的プロセス• 有機環状化合物への反応
• serine family amino acid metabolic process
• L-serine metabolic process
• cellular amino acid metabolic process
• D-serine metabolic process
• 老化
• pyruvate biosynthetic process
• response to morphine
• リポ多糖への反応
• D-serine biosynthetic process
• 代謝
• protein homotetramerization
• 脳発生
• L-serine biosynthetic process
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種ヒトマウス
Entrez

63826

27364

Ensembl

ENSG00000167720

ENSMUSG00000001323

UniProt

Q9GZT4,I3L4B4

Q9QZX7

RefSeq
(mRNA)

NM_001304803
NM_021947

NM_001163311
NM_013761
NM_001362742
NM_001362743
NM_001362744

RefSeq
(タンパク質)

NP_001291732
NP_068766

NP_001156783
NP_038789
NP_001349671
NP_001349672
NP_001349673

場所
(UCSC)		Chr 17: 2.3 – 2.33 MbChr 17: 74.8 – 74.82 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

セリンラセマーゼ(Serine racemase)は、L-セリンからD-セリンを生成する酵素である。D-セリンは、脳内でNMDA型グルタミン酸受容体を活性化させることで神経シグナル伝達分子として働く。ヒトでは、セリンラセマーゼタンパク質は、SRR遺伝子でコードされている[5]。

哺乳類のセリンラセマーゼは、ピリドキサールリン酸依存性の酵素であり、L-セリンからD-セリンへの異性化及びL-セリンから脱水してピルビン酸とアンモニアを生成する反応の両方を触媒する[6]。この酵素は、マグネシウムなどの2価のカチオンで生理的に活性化され、またマグネシウム/ATP複合体によってアロステリックに活性化される。

出典

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000167720 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001323 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Human PubMed Reference:
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:
  5. ↑ De Miranda J, Santoro A, Engelender S, Wolosker H (October 2000). "Human serine racemase: moleular cloning, genomic organization and functional analysis". Gene. 256 (1–2): 183–8. doi:10.1016/S0378-1119(00)00356-5. PMID 11054547。
  6. ↑ De Miranda J, Panizzutti R, Foltyn VN, Wolosker H (October 2002). "Cofactors of serine racemase that physiologically stimulate the synthesis of the N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptor coagonist D-serine". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (22): 14542–7. doi:10.1073/pnas.222421299. PMC 137919. PMID 12393813。

関連文献

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  • Steffek AE, Haroutunian V, Meador-Woodruff JH (July 2006). "Serine racemase protein expression in cortex and hippocampus in schizophrenia". NeuroReport. 17 (11): 1181–5. doi:10.1097/01.wnr.0000230512.01339.72. PMID 16837850。
  • Fujii K, Maeda K, Hikida T, Mustafa AK, Balkissoon R, Xia J, Yamada T, Ozeki Y, Kawahara R, Okawa M, Huganir RL, Ujike H, Snyder SH, Sawa A (February 2006). "Serine racemase binds to PICK1: potential relevance to schizophrenia". Molecular Psychiatry. 11 (2): 150–7. doi:10.1038/sj.mp.4001776. PMID 16314870。
  • Dumin E, Bendikov I, Foltyn VN, Misumi Y, Ikehara Y, Kartvelishvily E, Wolosker H (July 2006). "Modulation of D-serine levels via ubiquitin-dependent proteasomal degradation of serine racemase". The Journal of Biological Chemistry. 281 (29): 20291–302. doi:10.1074/jbc.M601971200. PMID 16714286。
  • Strisovsky K, Jiraskova J, Barinka C, Majer P, Rojas C, Slusher BS, Konvalinka J (January 2003). "Mouse brain serine racemase catalyzes specific elimination of L-serine to pyruvate". FEBS Letters. 535 (1–3): 44–8. doi:10.1016/s0014-5793(02)03855-3. PMID 12560076。
  • Hoffman HE, Jiraskova J, Ingr M, Zvelebil M, Konvalinka J (January 2009). "Recombinant human serine racemase: enzymologic characterization and comparison with its mouse ortholog". Protein Expression and Purification. 63 (1): 62–7. doi:10.1016/j.pep.2008.09.003. PMID 18812225。
  • Sarras H, Semeralul MO, Fadel MP, Feldcamp LA, Labrie V, Wong AH (July 2010). "Elevated PICK1 mRNA in schizophrenia increased SRR mRNA in suicide". Schizophrenia Research. 120 (1–3): 236==7. doi:10.1016/j.schres.2010.03.002. PMID 20385472。
  • Yamada K, Ohnishi T, Hashimoto K, Ohba H, Iwayama-Shigeno Y, Toyoshima M, Okuno A, Takao H, Toyota T, Minabe Y, Nakamura K, Shimizu E, Itokawa M, Mori N, Iyo M, Yoshikawa T (June 2005). "Identification of multiple serine racemase (SRR) mRNA isoforms and genetic analyses of SRR and DAO in schizophrenia and D-serine levels". Biological Psychiatry. 57 (12): 1493==503. doi:10.1016/j.biopsych.2005.03.018. PMID 15953485。
  • Xia M, Liu Y, Figueroa DJ, Chiu CS, Wei N, Lawlor AM, Lu P, Sur C, Koblan KS, Connolly TM (June 2004). "Characterization and localization of a human serine racemase". Brain Research. Molecular Brain Research. 125 (1–2): 96==104. doi:10.1016/j.molbrainres.2004.03.007. PMID 15193426。

外部リンク