ハフニア科
| ハフニア科 | ||||||||||||||||||
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寒天培地上のHafnia alveiコロニー | ||||||||||||||||||
| 分類 | ||||||||||||||||||
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| 学名 | ||||||||||||||||||
| Hafniaceae Adeolu et al. 2016[1] (IJSEMリストに掲載 2017)[2] | ||||||||||||||||||
| タイプ属 | ||||||||||||||||||
| ハフニア属 Hafnia Møller 1954[3] (IJSEMリストに掲載 1980)[4] | ||||||||||||||||||
| 下位分類(属) 2026年10月現在[5] | ||||||||||||||||||
特徴
カタラーゼ陽性、オキシダーゼ陰性、及びリシン脱炭酸酵素陰性である。また、マッコンキー寒天培地で増殖可能であり、硝酸塩を還元する能力を持つ[1]。本科の細菌は、表1に列挙したタンパク質に見られる保存されたシグネチャーインデル(挿入・欠失)によって、他のすべての細菌と区別することができる。
| タンパク質 | GenBankアクセッション番号 | インデルサイズ | インデル位置 |
|---|---|---|---|
| 二成分制御系応答調節因子GIrR | WP_025800188 | 1 aa ins | 104–149 |
| グルコース-1-リン酸アデニリル転移酵素 | WP_025799356 | 2 aa ins | 252–286 |
| 転写活性化因子NhaR | WP_004089142 | 2 aa ins | 241–272 |
| ハイブリッド型センサーヒスチジンキナーゼ/応答調節因子 | WP_004847184 | 4 aa del | 134–168 |
脚注
- 1 2 3 Mobolaji Adeolu, Seema Alnajar, Sohail Naushad and Radhey S. Gupta (01 December 2016). “Genome-based phylogeny and taxonomy of the ‘Enterobacteriales’: proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 66 (12): 5575-5599. doi:10.1099/ijsem.0.001485. PMID 27620848.
- ↑ Aharon Oren and George M. Garrity (01 March 2017). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations and new taxonomic opinions have appeared in volume 66, part 12, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 67 (3): 525-528. doi:10.1099/ijsem.0.001834.
- 1 2 VAGN MØLLER (September 1954). “Distribution of amino acid decarboxylases in Enterobacteriaceae”. Acta Pathologica Microbiologica Scandinavica. doi:10.1111/j.1699-0463.1954.tb00869.x. PMID 13197047.
- 1 2 3 4 V. B. D. Skerman; Vicki. McGOWAN; P. H. A. Sneath (01 January 1980). “Approved Lists of Bacterial Names”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 30 (1): 225-420. doi:10.1099/00207713-30-1-225.
- ↑ Jean P. Euzéby, Aidan C. Parte. “Family Hafniaceae”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. 2026年10月11日閲覧。
- ↑ W. H. Ewing, A. C. Mcwhorter, M. R. Escobar and A. H. Lubin (01 January 1965). “Edwardsiella, a new genus of Enterobacteriaceae based on a new species, E. tarda”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology: 33-38. doi:10.1099/00207713-15-1-33.
- ↑ Shimwell JL (1963). “Obesumbacterium gen. nov.”. Brewers Journal 99: 759-760.