殺菌剤（さっきんざい）は、一般に、病原性あるいは有害性を有する微生物を殺すための薬剤をいう。

医薬品、農薬や工業用品などがあるが、呼び方や内容が異なるので以下のように分けて記載する。それぞれの項目を参照。

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