サテライトDNA (Satellite DNA) は、巨大なタンデムリピートの繰り返しから構成される、ノンコーディングDNAである。
セントロメアの機能の重要な役割を担っており、構造的にはヘテロクロマチンの主要な構成要素である[1][2]。
「サテライトDNA」という名称は、密度勾配遠心を行った際にゲノムDNAのバンドとは別に小さなバンドを生じることにちなむ。これはサテライトDNAが短い塩基配列の繰り返しであるため、アデニン、シトシン、グアニン、チミンの各塩基の構成比がゲノム配列のそれと異なっており、これが密度の違いを生じて2本目、またはその他の小さなバンド(サテライト)を生じることによる[3]。
サテライトDNAは、ミニサテライトやマイクロサテライトと共に反復配列(タンデムリピート)と呼ばれる[4]。
ヒトゲノム中には以下のようなサテライトDNAが存在する。
| 種類 | 繰り返し単位配列長 (bp) | 染色体中の場所 |
|---|---|---|
| α (alphoid DNA) | 170 [5] | 全染色体 |
| β | 68 | セントロメア 1, 9, 13, 14, 15, 21, 22 and Y |
| サテライト1 | 25-48 | ほとんどの染色体のセントロメアとヘテロクロマチン内 |
| サテライト2 | 5 | ほとんどの染色体 |
| サテライト3 | 5 | ほとんどの染色体 |
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