ラディキシン

ウィキペディアから、無料の百科事典
RDX
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

1GC6, 1GC7, 1J19, 2D10, 2D11, 2D2Q, 2EMS, 2EMT, 2YVC, 2ZPY

識別子
記号RDX, DFNB24, radixin
外部IDOMIM: 179410 MGI: 97887 HomoloGene: 37707 GeneCards: RDX
遺伝子の位置 (ヒト)
11番染色体 (ヒト)
染色体11番染色体 (ヒト)[1]
11番染色体 (ヒト)
RDX遺伝子の位置
RDX遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点109,864,295 bp[1]
終点110,296,712 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
9番染色体 (マウス)
染色体9番染色体 (マウス)[2]
9番染色体 (マウス)
RDX遺伝子の位置
RDX遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点51,958,473 bp[2]
終点52,011,763 bp[2]
RNA発現パターン




さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能• protein homodimerization activity
• protein domain specific binding
• ATPase binding
• protein kinase A binding
• cytoskeletal protein binding
• 血漿タンパク結合
• actin binding
• RNA結合
• cadherin binding
細胞の構成要素• 細胞質
• 膜
• 焦点接着
• 糸状偽足
• ruffle
• ミエリン鞘
• 細胞膜
• apical part of cell
• stereocilium
• 微絨毛
• apical plasma membrane
• cortical actin cytoskeleton
• 分裂溝
• エキソソーム
• 細胞骨格
• 細胞周辺
• 膜状仮足
• midbody
• 横行小管
• cell tip
• 細胞外空間
• cell projection
生物学的プロセス• regulation of cell size
• establishment of endothelial barrier
• microvillus assembly
• regulation of organelle assembly
• タンパク質局在化の確立
• positive regulation of cell migration
• regulation of GTPase activity
• positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
• negative regulation of homotypic cell-cell adhesion
• regulation of actin filament bundle assembly
• positive regulation of gene expression
• negative regulation of GTPase activity
• negative regulation of adherens junction organization
• apical protein localization
• actin filament capping
• cellular response to thyroid hormone stimulus
• regulation of cell shape
• protein kinase A signaling
• regulation of ruffle assembly
• positive regulation of protein localization to early endosome
• positive regulation of early endosome to late endosome transport
• negative regulation of cell size
• regulation of Rap protein signal transduction
• cellular response to platelet-derived growth factor stimulus
• barbed-end actin filament capping
• protein localization to plasma membrane
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)
NM_002906
NM_001260492
NM_001260493
NM_001260494
NM_001260495

NM_001260496

NM_001104616
NM_001104617
NM_009041

RefSeq
(タンパク質)
NP_001247421
NP_001247422
NP_001247423
NP_001247424
NP_001247425

NP_002897

NP_001098086
NP_001098087
NP_033067

場所
(UCSC)
Chr 11: 109.86 – 110.3 MbChr 11: 51.96 – 52.01 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

ラディキシン(Radixin)は、ヒトではRDX遺伝子によりコードされるタンパク質である[5][6][7]。モエシン、エズリンとともにERMファミリーを構成する。

ラディキシンは細胞骨格タンパク質で、アクチンと細胞膜の結合に重要な役割を果たしている可能性がある。エズリンやモエシンと高度の配列類似性がみられる。RDX遺伝子は11q23に位置することが蛍光 in situ ハイブリダイゼーションにより特定されている。不完全なものをコードする偽遺伝子(RDXP2)がXp21.3に、イントロンを欠く別の偽遺伝子(RDXP1)が11pに存在する[7]。

相互作用

ラディキシンは、GNA13とタンパク質間相互作用する[8]。

出典

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137710 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032050 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Human PubMed Reference:
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:
  5. ↑ “Molecular cloning, cDNA sequence, and chromosomal assignment of the human radixin gene and two dispersed pseudogenes”. Genomics 16 (1): 199-206. (June 1993). doi:10.1006/geno.1993.1159. PMID 8486357.
  6. ↑ “Mutations of the RDX gene cause nonsyndromic hearing loss at the DFNB24 locus”. Hum Mutat 28 (5): 417-23. (April 2007). doi:10.1002/humu.20469. PMID 17226784.
  7. 1 2 “Entrez Gene: RDX radixin”. 2020年3月31日閲覧。
  8. ↑ “Conformational activation of radixin by G13 protein alpha subunit”. J. Biol. Chem. 275 (34): 26206-12. (August 2000). doi:10.1074/jbc.M001863200. PMID 10816569.

関連文献