下位分類（2020年代）

2022年の知見に基づく下位分類は以下のとおり。特筆しない限り、World Register of Marine Species (WoRMS) のデータに基づく。

• ordo Eunicida –（和名） イソメ目
  • † Eunicida fossil incertae sedis –（意訳）分類地位不確定の化石種

• †genus Andiprion Hints, Tonarová, Eriksson, Rubinstein et De la Puente, 2017

（音写+属）アンディプリオン属。（学名の原義）「アンデスの鋸（のこぎり）」の意^[7]。

（備考）化石産出年代については確信的情報なし^[8][9][10]。産出地は、アルゼンチン北西部にあるスバンディナス山脈 (Sierras Subandinas；シエラ・スバンディナス) のカピーニャス・セクション (Capillas section) ^[8]。スバンディナス山脈の周辺地域には古生代オルドビス紀の地層が広がっている^[8]が、そこまでは遡らない。グループ全体の下限が石炭紀なので、そこまで。

• †familia Atraktoprionidae Kielan-Jaworowska, 1966 ^[11]

（和名）未確認。（代表属の音写名を冠する仮称）アトラクトプリオン科。

• †familia Conjungaspidae Hints, 1999 ^[12]

（和名）未確認。（代表属の音写名を冠する仮称）コンジュンガスピス科。

• †familia Tretoprionidae Hints, 1999 ^[13]

（和名）未確認。（代表属の音写名を冠する仮称）トレトプリオン科。

• familia Dorvilleidae Chamberlin, 1919

（和名）ノリコイソメ科

• familia Eunicidae Berthold, 1827

（和名）イソメ科

（備考）和名がある種としては、イワムシ（Marphysa 属の1種 M. sanguinea）、オニイソメ（イソメ属（英語版）の1種 E. aphroditois）、サンゴイソメ（イソメ属の1種 E. tibiana）などを挙げることができる^[14]。

• familia Hartmaniellidae Imajima, 1977

（和名）ハートマンイソメ科

• familia Ichthyotomidae Eisig, 1906

（和名）サカナヤドリゴカイ科

• familia Lumbrinereidae Malmgren, 1867 ^[6]

（和名）未確認

（備考）化石産出年代は、326.4 to 318.1 Ma^[6]（約3億2640万年前 – 約3億1810万年前、古生代石炭紀ミシシッピアン亜紀（英語版）〈=前期石炭紀〉サープコビアン後期 – ペンシルバニアン亜紀（英語版）〈=後期石炭紀〉バシキーリアン中葉）。産出地は、米国（モンタナ州）^[6]。一説には Lumbrineridae Schmarda, 1861 のシノニム。

• familia Lumbrineridae Schmarda, 1861

（和名）ギボシイソメ科

• familia Oenonidae Kinberg, 1865

（和名）セグロイソメ科

• familia Onuphidae Kinberg, 1865

（和名）ナナテイソメ科

• Family incertae sedis –（意訳）分類不確定の科。（備考）イソメ目に含める説があるもの。

• familia Diurodrilidae Kristensen et Niilonen, 1982 ^[6]

（和名）未確認。（代表属の音写名を冠する仮称）ディウロドリラス科。

• familia Histriobdellidae Claus et Moquin-Tandon, 1884 ^[6]

（和名）未確認。（代表属の音写名を冠する仮称）ヒストリオブデッラ科。