箱根園水族館

1979年に開業した、標高723メートル^[1]に位置する水族館である。魚類・爬虫類・コツメカワウソ・ゴマフアザラシ・ペンギン^{[注釈 1]}を展示する海水館・淡水館とで構成され、450種類32,000点の生物が飼育・展示されている。2003年には「バイカルアザラシ広場」が設置され、2009年に「温泉アザラシ」が知られるようになった。

2013年12月から海水館の大水槽でハナゴンドウの展示も行い、一般公募の中から「結(ユイ)」と名付けられた。結は2015年5月31日に死亡し、現在は展示されていない。

園内で使用される海水は、西武グループ系列の伊豆・三津シーパラダイス施設内（沼津市内浦湾）で取水され、タンクローリーで毎日輸送されているものである。

箱根園コテージ&アネックス

1976年に箱根プリンスホテル（現・ザ・プリンス箱根）の付属施設として、「プリンスコテージ」と「キャンピングコテージ」として開業した。宿泊コテージ ・キャンプ場（炊事場）・浴場で構成されている。1986年にはプリンスホテルの別館として「レイクサイドアネックス」が開業した。

2010年よりこれら施設が箱根園に移管され、「箱根園コテージ&アネックス」となる。プリンスコテージは「箱根園コテージ ウエスト」、キャンピングコテージは季節営業の「箱根園コテージ キャンピング」に改称した。

ゴルフ場

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富士芦ノ湖パノラマパーク

旧称「箱根ピクニックガーデン」（2008年頃改称）。ザ・プリンス箱根から離れた、県道75号に所在する緑地施設でドッグランがある。敷地面積は8ヘクタールを超える。

施設内にゆり園（埼玉県所沢市、旧ユネスコ村）の姉妹施設として整備される「ゆり園」（夏季のみ営業・有料）があった（2010年営業を終了）。

箱根九頭龍の森

富士芦ノ湖パノラマパークの向かい・湖畔側にある緑地施設。入場料あり、営業時間あり。

九頭龍神社本宮が鎮座している。

キッズランド＆ハムスターランド

1996年に「箱根園バーチャルシアター」（ユネスコ村 大恐竜探検館に設置されたものと同じくインタミン製）として開業。2008年8月1日にフジテレビショップを設置し「フジテレビショップ&シアター」として、施設改装する形で新たに開業した。

2012年「キッズランド＆ハムスターランド」に施設名称変更。それに伴い、シアターの稼動は終了している。

箱根旅助け/バスフリー

• 箱根旅助けでは、伊豆箱根バス（箱根地区-小田原駅・湯河原駅・熱海駅間の指定路線）と伊豆箱根鉄道の芦ノ湖遊覧船・駒ヶ岳ロープウェー・十国峠ケーブルカーが利用可能であり、箱根園水族館の入園が無料となっている。
• 箱根バスフリーでは、箱根旅助けの交通機関フリーパスを単体化した商品であり、箱根園（水族館含む）施設は優待料金での利用となる。

箱根フリーパス

• 箱根フリーパスでは伊豆箱根バス・芦ノ湖遊覧船は利用対象外であり、箱根園に乗り入れる対象路線は小田急ハイウェイバスの新宿 -（箱根園経由） - 小田急山のホテル間の路線と、御殿場駅 - 元箱根港、桃源台 - 元箱根港の路線(山内シャトル便)がある。
  • フリーパス提示により、箱根園運営施設と関係施設の料金優待が受けられる。