日本の重要湿地500

北海道地方

東北地方

関東地方

中部地方

近畿地方

中国地方

四国地方

九州地方

沖縄地方

• 屋嘉田潟原
• 億首川流域
• ヤンバル河川群
• 沖縄本島東沿岸（辺野古～漢那）
• 慶武原川
• 東村の慶佐次マングローブと流入河川
• 喜如嘉（水田地帯）
• 大浦湾および大浦川
• 屋我地（羽地内海を含む）
• アミスガー・ハマサ
• 水納島周辺沿岸
• 残波岬地先沿岸
• 藪地島周辺沿岸
• 中城湾（泡瀬干潟・佐敷干潟など）
• 漫湖 ※
• 具志干潟～大嶺岬周辺沿岸
• 屋富祖井
• 与根干潟
• 瀬底島の小湿地および周辺沿岸
• 塩川
• 斎場御嶽
• 渡名喜島周辺沿岸
• 南大東島の池と洞窟群
• 慶良間諸島渡嘉敷島の山地水域
• 慶良間諸島周辺沿岸 ※
• 久米島の渓流・湿地
• 八重干瀬
• 宮古島中北部の湿地
• 宮古島の洞窟群と湧泉群
• 池間島湿原と周辺サンゴ礁
• 島尻入江
• 宮古島東部（東平安名崎）沿岸
• 嘉手刈入江
• 与那覇湾およびその周辺
• 伊良部島の入江
• 平久保半島北東沿岸
• 嘉良川
• 吹通川河口域およびその沿岸
• 川平湾、米原地先沿岸
• カピラ湧水および川平の水田
• 御神崎～石崎地先沿岸
• 名蔵湾および名蔵川集水域 ※
• 宮良湾・宮良川河口域
• 白保海岸とその沿岸
• 石西礁湖
• 西表島山地水域および平地部天然陸水域
• 大正池付近
• 仲間川
• 後良川・相良川・前良川
• 由布島および干潟
• 小浜島（細崎－アカヤ崎）
• 船浦湾と流入河川
• 浦内川
• 西表島南西部海域および河口域
• 与那国島の湿地・河川

北海道地方

• 利尻島湿地群（利尻郡利尻富士町）
• 利尻島・礼文島周辺沿岸（利尻郡利尻町・利尻富士町、礼文郡礼文町）
• 久種湖（礼文郡礼文町）
• メグマ沼湿原、声問大沼・声問川（稚内市）
• 猿払原野（宗谷郡猿払村）
• クッチャロ湖（枝幸郡浜頓別町）
• サロベツ原野（天塩郡豊富町・幌延町・天塩町など）
• 天塩川（天塩郡天塩町・幌延町・豊富町、中川郡中川町・音威子府村・美深町、名寄市、上川郡下川町）
• 中峰の平湿原（天塩郡幌延町）
• 松山湿原およびピヤシリ湿原（中川郡美深町、紋別郡雄武町）
• コムケ湖（紋別市、紋別郡湧別町）
• シブノツナイ湖（紋別市、紋別郡湧別町）
• サロマ湖（北見市、常呂郡佐呂間町、紋別郡湧別町）
• 能取湖（網走市）
• 網走能取岬周辺沿岸（網走市）
• 網走湖（網走市、網走郡大空町）
• 藻琴湖および濤沸湖（網走市、斜里郡小清水町）
• ガッタンコ湿原（斜里郡斜里町）
• 知床半島サケ・カラフトマス遡上河川群（斜里郡斜里町、目梨郡羅臼町、標津郡標津町）
• 知床半島山稜湿原（目梨郡羅臼町）
• 知床半島東部沿岸（目梨郡羅臼町）
• 野付半島、野付湾、尾岱沼（標津郡標津町、野付郡別海町）
• 標津湿原（標津郡標津町、中標津町）
• 茨散沼湿原、兼金沼・西別川湿原（野付郡別海町）
• 根室半島湿原群（根室市）
• 根室湾干潟（根室市）
• 風蓮湖、春国岱、温根沼および周辺湿原群（根室市、野付郡別海町、厚岸郡浜中町）
• ユルリ島湿原（根室市）
• 霧多布湿原・幌戸湿原および地先沿岸（厚岸郡浜中町）
• 火散布沼および藻散布沼（厚岸郡浜中町）
• 厚岸湖（厚岸郡厚岸町）
• 厚岸湾（厚岸郡厚岸町、釧路郡釧路町）
• 別寒辺牛湿原（厚岸郡厚岸町）
• 屈斜路湖周辺および釧路川源流域（川上郡弟子屈町）
• 阿寒湖と流入・流出河川（釧路市）
• 釧路湿原（釧路市、釧路郡釧路町、川上郡標茶町・弟子屈町、阿寒郡鶴居村）
• 然別湖（河東郡上士幌町・鹿追町）
• 馬主来沼（釧路市、白糠郡白糠町）
• キナシベツ湿原および音別川・尺別川（釧路市）
• 十勝海岸湖沼群（中川郡豊頃町、広尾郡大樹町）
• 十勝川下流湖沼群（中川郡豊頃町・池田町、十勝郡浦幌町）
• 更別湿原（河西郡更別村）
• 襟裳岬周辺沿岸（幌泉郡えりも町）
• 朱鞠内湖（雨竜郡幌加内町）
• 浮島湿原（上川郡上川町）
• 大雪山系旭岳周辺湿原群（上川郡上川町・東川町）
• 大雪山系トムラウシ山周辺湿原群（上川郡新得町・上川町）
• 雨竜沼湿原（雨竜郡雨竜町）
• 原始ヶ原湿原（富良野市）
• かなやま湖（空知郡南富良野町）
• 石狩川流域湖沼群（砂川市、樺戸郡新十津川町、美唄市、空知郡奈井江町）
• 美唄湿原（美唄市）
• 月ヶ湖湿原（樺戸郡月形町）
• 幌向湿原（江別市）
• 石狩川河口（石狩市）
• 旧長都沼（夕張郡長沼町、千歳市）
• 千歳川（千歳市）
• 勇払原野湿原群（苫小牧市、千歳市、勇払郡安平町・厚真町）
• 厚真水田および鵡川水田（勇払郡厚真町・むかわ町）
• 鵡川河口（勇払郡むかわ町）
• ホロホロ湿原（白老郡白老町）
• 倶多楽湖（白老郡白老町）
• ヨコスト湿原（白老郡白老町）
• キウシト湿原（登別市）
• 篠路福移湿原（札幌市）
• 泊村盃地区地先沿岸（古宇郡泊村）
• 後志山地湿原群（札幌市、虻田郡京極町）
• ニセコ連山湿原群（虻田郡倶知安町・ニセコ町、磯谷郡蘭越町、岩内郡共和町）
• 朱太川水系（寿都郡黒松内町）
• 歌才湿原（寿都郡黒松内町）
• 静狩湿原（山越郡長万部町）
• 大沼と周辺湿地（亀田郡七飯町）
• 横津岳湿原群（亀田郡七飯町）
• 汐首岬周辺沿岸（函館市）
• 函館湾周辺沿岸（函館市、北斗市、上磯郡木古内町）^[3]

東北地方

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関東地方

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中部地方

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近畿地方

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中国地方

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四国地方

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九州地方

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沖縄地方

• 伊平屋島田名湿地帯（島尻郡伊平屋村）
• やんばる河川群（国頭郡国頭村・大宜味村・東村）
• 沖縄本島東沿岸（名護市、国頭郡宜野座村・東村・国頭村）
• 慶佐次マングローブと流入河川（国頭郡東村）
• 喜如嘉の湿地帯（国頭郡大宜味村）
• 塩屋湾（国頭郡大宜味村）
• 大浦川および河口部（名護市）
• 屋我地（羽地内海を含む）（名護市、国頭郡今帰仁村）
• アミスガー（国頭郡今帰仁村）
• 瀬底島の小湿地および周辺沿岸（国頭郡本部町）
• 塩川（国頭郡本部町）
• 水納島周辺沿岸（国頭郡本部町）
• 慶武原川（国頭郡宜野座村）
• 大久保ガー（国頭郡宜野座村）
• 漢那ダム（国頭郡宜野座村）
• 億首川流域（国頭郡金武町）
• 屋嘉田潟原（国頭郡恩納村）
• 瀬良垣海岸（国頭郡恩納村）
• 残波岬周辺沿岸（中頭郡読谷村）
• 伊計島東岸地先（うるま市）
• 藪地島周辺沿岸（うるま市）
• 中城湾（うるま市、中頭郡北中城村・中城村、沖縄市、島尻郡与那原町、南城市）
• 大山湿地（宜野湾市）
• 漫湖（那覇市、豊見城市）
• 育徳泉（那覇市）
• 具志干潟から大嶺岬周辺沿岸（那覇市、豊見城市）
• 与根干潟および豊崎干潟（豊見城市）
• 米須海岸（糸満市）
• 斉場御獄（南城市）
• コマカ島（南城市）
• 屋富祖井（島尻郡八重瀬町）
• 慶良間諸島渡嘉敷島の山地水域（島尻郡渡嘉敷村）
• 慶良間諸島周辺沿岸（島尻郡座間味村・渡嘉敷村）
• 渡名喜島周辺沿岸（島尻郡渡名喜村）
• 久米島の渓流・湿地（島尻郡久米島町）
• 久米島の干潟および河口（島尻郡久米島町）
• 南大東島の池と洞窟群（島尻郡南大東村）
• 八重干瀬（宮古島市）
• 池間湿原と周辺サンゴ礁（宮古島市）
• 島尻入江（宮古島市）
• 宮古島中北部の湿地（宮古島市）
• 宮古島の洞窟群と湧泉群（宮古島市）
• 宮古島東部（東平安名崎）沿岸（宮古島市）
• 嘉手刈入江（宮古島市）
• 与那覇湾および周辺（宮古島市）
• 伊良部島の入江（宮古島市）
• 平久保半島北東沿岸（石垣市）
• 嘉良川（石垣市）
• 吹通川河口および沿岸（石垣市）
• 川平湾、米原地先沿岸（石垣市）
• カビラ湧水および川平の水田（石垣市）
• 御神崎から石崎地先沿岸（石垣市）
• 名蔵湾および名蔵川集水域（石垣市）
• 宮良湾および宮良川集水域（石垣市）
• 白保海岸とその沿岸（石垣市）
• 石西礁湖（八重山郡竹富町）
• 西表島の山地陸水域（八重山郡竹富町）
• 西表島の平地部の陸水域（八重山郡竹富町）
• 仲間川（八重山郡竹富町）
• 後良川、相良川、前良川（八重山郡竹富町）
• 由布島および干潟（八重山郡竹富町）
• 小浜島（細崎からアカヤ崎）（八重山郡竹富町）
• 船浦湾と流入河川（八重山郡竹富町）
• 浦内川（八重山郡竹富町）
• 西表島南西部海域および河口（八重山郡竹富町）
• 与那国島の湿地・河川（八重山郡与那国町）^[4]